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Solvation Effects on Free Energy Surface of Polyalanine

机译:溶剂化对聚丙氨酸自由能表面的影响

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摘要

We have simulated 10-residue polyalanine chain by multicanonical method tovisualize the 3D topographic picture of the free energy landscape over thewhole range of temperatures, hence to show the funnel along the folding pathwayexhaustively. We have simulated and compared the system in vacuo and insolvent, and examined the changes in the free energy landscape due to thesolvent effects, which are taken into account by commonly used model AccessibleSurface Area.
机译:我们通过多规范方法模拟了10个残基的聚丙氨酸链,以在整个温度范围内可视化自由能景观的3D地形图,从而详尽地显示了沿折叠路径的漏斗。我们已经在真空和无溶剂状态下对系统进行了模拟和比较,并检查了由于溶剂效应引起的自由能态的变化,常用的模型AccessibleSurface Area考虑了这一点。

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